相对于福保，盐保，以及香港走一日游的形式，加工区更能体现的优势是机动灵活，福保及盐保在时效性的要求很高，要求一定要海关监管车，换车等多种规定。走香港的话就是要大量的时间成本及港车费用。但是在深圳出口加工区就没有这些规定，普通货车可以报关，一次一日游报关时间只需要30分钟左右，当天来当天走，通关极为便捷！
2.报关费成本：加工区一进一出报关费，无杂费。
3.估价成本 ：进口如是一般贸易，进口估价时加工区海关为了鼓励新进企业在估价方面给予一定支持。
4.时间成本：报关资料提前发送，无时间限制，马上可以完成进出，节约时间成本以及如报关不能当天完成所产生的其他附加成本。
5.无需做商检（限于监管条件为B的物品）
6.退税：对于进入出口加工区的货物，当天报关，即可帮贵司打出出口退税联。为贵司大大解放了资金的压力，资金流通的顺利也为贵司更好的生产，而且可以解决报关资料不附（双方商品编码不相同）的问题。
案例：加贸企业A从国外进口料件塑胶粒，在国内生产出半成品五金塑胶片，然后复出口核销。东莞另一加贸企业B从国外进口料件五金塑胶片，在国内生产出成品五金，然后复出口核销。
说明： A需出口核销的半成品刚好是B需进口的料件，通过转厂A就可以把五金塑胶片销售给B。在转厂过程中，A等于把五金塑胶片出口核销了，B等于从国外进口了五金塑胶片，B把A的五金塑胶片生产出成品五金后依然后出口核销。
1、深加工结转
东莞A公司和深圳B公司都是加工贸易企业，东莞A公司生产继电器，A出口核销的继电器刚好是B需进口的料件。他们之前的做法是两家企业直接通过手册与手册之间进行深加工结转交易，做法是通过办理关封拆关等操作手续进行，手续涉及到：1.资料审定 2.办理关封 3.送货及收货 4.办理报关。耗费时间长，成本高。而且外汇局应不定期对从事深加工结转（转厂）的企业进行检查，对违反本操作程序及其他外汇管理规定的，应当按照相关规定予以处罚。
现在两家企业通过C公司，进行保税区转厂，A和B公司只需提供报关资料给C，在东莞办理出口转关到深圳出口加工区（保税区）供应链，实现出口核销操作；而深圳B公司则以手册在出口加工区申报进口操作，实现转厂、交货的目的。
一、什么叫转厂(出口转内销）
转厂(出口复进口)是指企业将保税料件加工的产品结转至另一直属或属海关内的加工企业加工后复出口的经营活动。传统的深加工结转是这样的：
例如：东莞A公司和深圳B公司都是加工贸易企业，东莞A公司生产继电器，A出口核销的继电器刚好是B需进口的料件。他们之前的做法是两家企业直接通过手册与手册之间进行深加工结转交易，做法是通过办理关封拆关等操作手续进行，手续涉及到：1.资料审定 2.办理关封 3.送货及收货 4.办理报关。耗费时间长，成本高。而且外汇局应不定期对从事深加工结转（转厂）的企业进行检查，对违反本操作程序及其他外汇管理规定的，按照相关规定予以处罚。
我们从上面的例子可以看到：传统的做法手续非常繁琐，而且时间很长，不能退税。但是如果通过深圳保税区进行转厂贸易，就可以避免这些：
现在：现在两家企业通过C公司进行保税区转厂，A和B公司只需提供报关资料给C，在东莞办理出口转关到深圳出口加工区（保税区），实现出口核销操作；而深圳B公司则以手册在出口加工区申报进口操作，实现转厂、交货的目的。名称：深圳出口加工区转厂一日游的优势